1、營業稅方面：

　　《國家稅務總局關于印發<營業稅問題解答(之一)>的通知》(國稅函發〔1995〕156號)，相關規定如下：(一)土地使用權和房屋所有權相互交換，雙方都取得了擁有部分房屋的所有權。在這一合作過程中，甲方以轉讓部分土地使用權為代價，換取部分房屋的所有權，發生了轉讓土地使用權的行為;乙方則以轉讓部分房屋的所有權為代價，換取部分土地的使用權，發生了銷售不動產的行為。因而合作建房的雙方都發生了營業稅的應稅行為。對甲方應按"轉讓無形資產"稅目中的"轉讓土地使用權"子目征稅;對乙方應按"銷售不動產"稅目征稅。由于雙方沒有進行貨幣結算，因此應當按照《中華人民共和國營業稅暫行條例實施細則》第十五條的規定分別核定雙方各自的營業額。如果合作建房的雙方(或任何一方)將分得的房屋銷售出去，則又發生了銷售不動產行為，應對其銷售收入再按"銷售不動產"稅目征收營業稅。

2、土地增值稅方面：

　　《財政部 國家稅務總局關于土地增值稅一些具體問題規定的通知》(財稅字〔1995〕48號) 規定："二、關于合作建房的征免稅問題對于一方出地，一方出資金，雙方合作建房，建成后按比例分房自用的，暫免征收土地增值稅;建成后轉讓的，應征收土地增值稅。"

　　兩個單位合作建房，一方出地，一方出資金，建成后按比例分房自用，是否需要繳納土地增值稅?根據《財政部、國家稅務總局關于土地增值稅一些具體問題規定的通知》(財稅〔1995〕48號)第二條規定，對于一方出地，一方出資金，雙方合作建房，建成后按比例分房自用的，暫免征收土地增值稅。

　　【納稅事項】：轉讓國有土地使用權、地上的建筑物及其附著物并取得收入，是指以出售或者其他方式有償轉讓房地產的行為。不包括以繼承、贈與方式無償轉讓房地產的行為。國有土地，是指按國家法律規定屬于國家所有的土地。地上的建筑物，是指建于土地上的一切建筑物，包括地上地下的各種附屬設施。附著物，是指附著于土地上的不能移動，一經移動即遭損壞的物品。

　　【計算公式】：應納土地增值稅=增值額×稅率(具體內容在“土地增值稅的計算方法” 中介紹)

　　【納稅期限】：納稅人應自轉讓房地產合同簽訂之日起七日內向稅務機關申報納稅。

　　【納稅地點】：向房地產所在地主管稅務機關辦理納稅申報，并在稅務機關核定的期限內繳納土地增值稅。納稅人轉讓房地產座落在兩個或兩個以上地區的，應按房地產所在地分別申報納稅。

　　【提交資料】：向稅務機關提交房屋及建筑物產權、土地使用權證書，土地轉讓、房產買賣合同，房地產評估報告及其他與轉讓房地產有關的資料。

　　【稅款清算】：納稅人在項目全部竣工結算前轉讓房地產取得的收入，由于涉及成本確定或其他原因，而無法據以計算土地增值稅的，可以預征土地增值稅，待該項目全部竣工、辦理結算后再進行清算，多退少補。具體辦法由各省、自治區、直轄市地方稅務局根據當地情況制定。