在計(jì)算繳納土地增值稅時(shí)，與轉(zhuǎn)讓有關(guān)的稅金允許扣除，該稅金是指在轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)時(shí)繳納的營(yíng)業(yè)稅、城市維護(hù)建設(shè)稅、教育費(fèi)附加、印花稅。

　　財(cái)稅字【1995】48號(hào)文件第十條規(guī)定：轉(zhuǎn)讓環(huán)節(jié)繳納的稅金對(duì)于個(gè)人購(gòu)入房地產(chǎn)再轉(zhuǎn)讓的，在其購(gòu)入時(shí)已繳納的契稅，在舊房及建筑物的評(píng)估價(jià)中已包括了此因素，在計(jì)征土地增值稅時(shí)，不另作為“與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金”予以扣除。

　　財(cái)稅【2006】21號(hào)文件第二條規(guī)定：納稅人轉(zhuǎn)讓舊房及建筑物，凡不能取得評(píng)估價(jià)格，但能提供購(gòu)房發(fā)票的，經(jīng)當(dāng)?shù)囟悇?wù)部門(mén)確認(rèn)，《條例》第六條第(一)、(三)項(xiàng)規(guī)定的扣除項(xiàng)目的金額，可按發(fā)票所載金額并從購(gòu)買(mǎi)年度起至轉(zhuǎn)讓年度止每年加計(jì)5%計(jì)算。對(duì)納稅人購(gòu)房時(shí)繳納的契稅，凡能提供契稅完稅憑證的，準(zhǔn)予作為“與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金”予以扣除，但不作為加計(jì)5%的基數(shù)。

　　綜上，該契稅是否能扣除，主要看繳納契稅時(shí)被歸屬什么項(xiàng)目及是否取得合法有效憑證。

　　根據(jù)財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于土地增值稅一些具體問(wèn)題規(guī)定的通知》第十一條規(guī)定：對(duì)于個(gè)人購(gòu)買(mǎi)房地產(chǎn)再轉(zhuǎn)讓的，其在購(gòu)入時(shí)已繳納的契稅，在舊房及建筑物的評(píng)估中已包括了此項(xiàng)因素，在計(jì)征土地增值稅時(shí)，不另作為"與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金"予以扣除。

　　與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金是指在轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)時(shí)繳納的營(yíng)業(yè)稅、城建稅、印花稅。因轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)繳納的教育費(fèi)附加，也視同稅金予以扣除。契稅不作為“與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金”，不予扣除。

　　根據(jù)《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于土地增值稅清算有關(guān)問(wèn)題的通知》(國(guó)稅函[2010]220號(hào))第五條規(guī)定，房地產(chǎn)開(kāi)發(fā)企業(yè)為取得土地使用權(quán)所支付的契稅，應(yīng)視同按國(guó)家統(tǒng)一規(guī)定交納的有關(guān)費(fèi)用，計(jì)入取得土地使用權(quán)所支付的金額中扣除。

　　根據(jù)《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于土地增值稅一些具體問(wèn)題規(guī)定的通知》(財(cái)稅字〔1995〕48號(hào))規(guī)定：“十一、關(guān)于已繳納的契稅可否在計(jì)稅時(shí)扣除的問(wèn)題對(duì)于個(gè)人購(gòu)入房地產(chǎn)再轉(zhuǎn)讓的，其在購(gòu)入時(shí)已繳納的契稅，在舊房及建筑物的評(píng)估價(jià)中已包括了此項(xiàng)因素，在計(jì)征土地增值稅時(shí)，不另作為‘與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金’予以扣除。”

　　根據(jù)《土地增值稅暫行條例》第六條和《土地增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第七條的規(guī)定，對(duì)于企業(yè)因違約而承受的處罰性開(kāi)支，如土地閑置費(fèi)及契稅滯納金等，不屬于按稅法規(guī)定正常開(kāi)支的成本費(fèi)用和國(guó)家統(tǒng)一規(guī)定交納的有關(guān)費(fèi)用，以及在轉(zhuǎn)讓環(huán)節(jié)繳納稅金的范疇，不能作為扣除的項(xiàng)目金額。因此，在計(jì)征土地增值稅時(shí)不能作為正常的成本費(fèi)用支出予以扣除。