根據《關于調整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關問題的通知》：

　　第三條、增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票、機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票以及海關繳款書，未在規(guī)定期限內到稅務機關辦理認證、申報抵扣或者申請稽核比對的，不得作為合法的增值稅扣稅憑證，不得計算進項稅額抵扣。

　　根據《關于調整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關問題的通知》：

　　第一條、增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票，應在開具之日起180日內到稅務機關辦理認證，并在認證通過的次月申報期內，向主管稅務機關申報抵扣進項稅額。

　　第二條、實行海關進口增值稅專用繳款書(以下簡稱海關繳款書)“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關繳款書，應在開具之日起180日內向主管稅務機關報送《海關完稅憑證抵扣清單》(包括紙質資料和電子數據)申請稽核比對。

　　未實行海關繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關繳款書，應在開具之日起180日后的第一個納稅申報期結束以前，向主管稅務機關申報抵扣進項稅額。

　　參考資料來源：國家稅務總局-關于調整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關問題的通知

　　根據《國家稅務總局關于全面推行增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版有關問題的公告》(國家稅務總局公告2015年第19號)規(guī)定，增值稅專用發(fā)票尚未交付購買方或者購買方拒收的，銷售方應于專用發(fā)票認證期限內在增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版中填開并上傳《信息表》。因此，除了屬于《國家稅務總局關于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》(國家稅務總局公告2011年第50號)第二條的客觀原因以外，超過認證期沒有認證的增值稅專用發(fā)票，不可以申請開具紅字增值稅專用發(fā)票。 客觀原因包括如下類型：

　　(一)因自然災害、社會突發(fā)事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾期;

　　(二)增值稅扣稅憑證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導致逾期;

　　(三)有關司法、行政機關在辦理業(yè)務或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報義務，或者稅務機關信息系統(tǒng)、網絡故障，未能及時處理納稅人網上認證數據等導致增值稅扣稅憑證逾期;

　　(四)買賣雙方因經濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務登記的時間過長，導致增值稅扣稅憑證逾期;

　　(五)由于企業(yè)辦稅人員傷亡、突發(fā)危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續(xù)，導致增值稅扣稅憑證逾期;

　　(六)國家稅務總局規(guī)定的其他情形。

　　答:我們先看看在2016年7月31日之前的規(guī)定，當時開具紅字增值稅專用發(fā)票的文件是《關于全面推行增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版有關問題的公告》(國家稅務總局公告2015年第19號)第五條第一款規(guī)定，一般納稅人開具增值稅專用發(fā)票或貨物運輸業(yè)增值稅專用發(fā)票(以下統(tǒng)稱專用發(fā)票)后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤、應稅服務中止以及發(fā)票抵扣聯(lián)、發(fā)票聯(lián)均無法認證等情形但不符合作廢條件，或者因銷貨部分退回及發(fā)生銷售折讓，需要開具紅字專用發(fā)票的，暫按以下方法處理。關鍵是，這一款下面還有一句話:專用發(fā)票尚未交付購買方或者購買方拒收的，銷售方應于專用發(fā)票認證期限內在增值稅發(fā)票系統(tǒng)升級版中填開并上傳《信息表》。

　　因此，在2016年7月31日前，文件是明確規(guī)定，超過認證期限的專用發(fā)票，是不得填開信息表進行沖紅處理的。

　　但是在2016年8月1日以后，總局又下發(fā)了一個新的文件，《國家稅務總局關于紅字增值稅發(fā)票開具有關問題的公告》(國家稅務總局公告2016年第47號 )第一條規(guī)定，增值稅一般納稅人開具增值稅專用發(fā)票后，發(fā)生銷貨退回、開票有誤、應稅服務中止等情形但不符合發(fā)票作廢條件，或者因銷貨部分退回及發(fā)生銷售折讓，需要開具紅字專用發(fā)票的，按以下方法處理:

　　銷售方開具專用發(fā)票尚未交付購買方，以及購買方未用于申報抵扣并將發(fā)票聯(lián)及抵扣聯(lián)退回的，銷售方可在新系統(tǒng)中填開并上傳《信息表》。銷售方填開《信息表》時應填寫相對應的藍字專用發(fā)票信息。

　　分析上述規(guī)定，尚未交付購買方的增值稅專用發(fā)票需要開具紅字發(fā)票，必須在“認證期限內”上傳《信息表》的規(guī)定已經作廢。2016年47號公告中并沒有規(guī)定必須在“認證期內”，從文件上說超過認證期限未認證的發(fā)票也可以開具紅字發(fā)票了，雖然可以從增值稅發(fā)票管理新系統(tǒng)中開出，但是超期未認證抵扣，開具紅票后重新開具藍字發(fā)票，再行抵扣的行為可能會給企業(yè)帶來涉稅風險。所以建議取得所屬稅務機關同意后，再行開具紅字發(fā)票。