丟失增值稅專用發票已報稅證明單一般可以到網上申請或者稅務局納稅大廳申請：

　　網上申請《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》流程：

　　1、登錄網上辦稅服務廳，插入安全證書(報稅U棒)。

　　2、在我要辦事-證明辦理-在丟失增值稅專用發票已報稅證明單開具那一行選擇辦理-填寫丟失增值稅專用發票的發票信息-保存、下一步直到遞交成功。

　　3、一般3個工作日左右，審批好丟失增值稅專用發票已抄報稅證明單，打印出來就可以了。

大廳申請：《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》申請流程：

　　1、申請。納稅人攜帶丟失增值稅專用發票的記賬聯復印件，公章到辦稅服務廳申報征收崗申請開具丟失增值稅專用發票已抄報稅證明單。

　　2、受理審核。辦稅服務廳申報征收崗受理審核納稅人提交的資料。符合條件的，當場受理辦理。納稅人提交紙質資料不全或者填寫內容不符合規定的，一次性告知納稅人補正或重新填報。

　　3、開具。納稅人提供資料符合條件的，辦稅服務廳申報征收崗即時開具丟失增值稅專用發票已抄報稅證明單。

無論你是銷貨方還是購貨方，已開具的增值稅專用發票丟失，按照國稅發（2006）156號文件第28條規定辦理：

　　第二十八條 一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯和抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》(附件5)，經購買方主管稅務機關審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證;如果丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件到主管稅務機關進行認證，認證相符的憑該專用發票記賬聯復印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》，經購買方主管稅務機關審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。

　　一般納稅人丟失已開具專用發票的抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，可使用專用發票發票聯復印件留存備查;如果丟失前未認證的，可使用專用發票發票聯到主管稅務機關認證，專用發票發票聯復印件留存備查。

　　一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯，可將專用發票抵扣聯作為記賬憑證，專用發票抵扣聯復印件留存備查。

丟失說明格式如下：

　　我公司(xxxx公司)，因保管不善，將20xx年xx月xx日(開票日期)開具的一份增值稅專用發票遺失。

　　發票代碼為 xxxxx，號碼為xxxxxx，稅額為xxxx元，價稅合計為XX元。

　　特此說明!

　　xxxx公司(加蓋公章)

　　20xx年xx月xx日(出具說明日期)

　　根據國家稅務總局《關于被盜、丟失增值稅專用發票有關問題的公告》規定，發生發票被盜、丟失情形時，使用發票的單位和個人應當于發現被盜、丟失當日書面說明報告稅務機關。

擴展資料

　　發票丟失，重新開具發票

　　1、一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯和抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》，經購買方主管稅務機關審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。

　　丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件到主管稅務機關認證，認證相符的憑該專用發票記賬聯復印件及銷售方所在地主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發已報稅證明單》，經購買方主管稅務機關同意后，可作為增值進項稅額的抵扣憑證。

　　2、一般納稅人丟已開具專用發票的抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，可使用專用發票聯復印件留存備查。

　　如果丟失前未認證的，可使用專用發票的發票聯到主管機關認證，專用發票的發票聯復印件留存備查。

　　3、一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯，可以將專用發票抵扣聯作為記賬憑證，專用發票抵扣聯復印件留存備查。

　　根據《國家稅務總局關于簡化增值稅發票領用和使用程序有關問題的公告》(國家稅務總局公告2014年第19號)，一般納稅人丟失已開具專用發票的發票聯和抵扣聯。

　　如果丟失前已認證相符的，購買方可憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件及銷售方主管稅務機關出具的《丟失增值稅專用發票已報稅證明單》或《丟失貨物運輸業增值稅專用發票已報稅證明單》，作為增值稅進項稅額的抵扣憑證;

　　如果丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應專用發票記賬聯復印件進行認證，認證相符的可憑專用發票記賬聯復印件及銷售方主管稅務機關出具的《證明單》，作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。專用發票記賬聯復印件和《證明單》留存備查。

　　一般納稅人丟失已開具專用發票的抵扣聯，如果丟失前已認證相符的，可使用專用發票聯復印件留存備查;如果丟失前未認證的，可使用專用發票發票聯認證，專用發票發票聯復印件留存備查。